W ramach realizacji Programu wymiany naukowej między Szwajcarią a nowymi państwami członkowskimi Unii Europejskiej, Polska przystąpiła do współpracy w Funduszu Stypendialnym realizowanym w obszarze tematycznym Badania i Rozwój, Szwajcarsko-Polskiego Programu Współpracy.

Głównym celem Programu jest zmniejszenie różnic społeczno-gospodarczych w rozszerzonej UE, poprzez rozwój potencjału pracowników naukowych oraz zacieśnienie kontaktów między pracownikami z Polski i Szwajcarii. Z Funduszu mogą korzystać przedstawiciele wszystkich dyscyplin akademickich.
W ramach Funduszu Stypendialnego, dofinansowanie można uzyskać na:

• wizyty stypendialne doktorantów i młodszych pracowników naukowych (z tytułem doktora) na prowadzenie badań naukowych w instytucjach badawczych Szwajcarii
(na okres od 6 do 24 miesięcy).
• wizyty samodzielnych pracowników naukowych z Polski lub Szwajcarii w celu przygotowania bądź realizacji projektów badawczych (5-dniowe pobyty w Szwajcarii lub w Polsce).

W dniu 29 marca 2012 r., przyznane zostało dofinansowanie dla 21 polskich projektów składanych od 1.09 do 01.11.2011 r. Łączna kwota dofinansowania wyniosła blisko 1,8 mln CHF. Projekty będą realizowane w obszarach: nauk ekonomicznych i społecznych, ochrony środowiska, biologii oraz medycyny. Pobyty naukowe będą trwały od 6 do 24 miesięcy, m.in na Uniwersytetach w Lozannie, Genewie, Bernie i Fribourgu oraz na ETH w Zurichu.
Za wdrażanie Funduszu Stypendialnego w Polsce odpowiada CRUS – Konferencja Rektorów Uniwersytetów Szwajcarskich.